为解决区划带来的运河治理难题，2022年7月，临西县检察院携手临清市检察院等沿河7县市，会签了《关于大运河流域治理检察公益协作机制实施意见》，结束了原先两岸河道治理、水生态环境保护“一事一议、按需推进”的被动式合作方式。
2022年10月，临西县检察院与临清市检察院首次启动协作机制，处置了临西县汪江村位居河道右侧的大面积阻水林木。

为进一步强化问题整治两岸协同应对，实现一体化履职，2023年7月，来自河北、山东两省七市运河沿岸县市的23名基层检察院检察长，在临西县举行运河流域治理问题研讨会，就运河保护工作机制落地落细问题，会签了《关于建立京杭大运河生态环境和资源保护公益诉讼协作机制》，为彻底化解区划壁垒障碍，提供了更加全面坚实的制度保障。

2023年7月，临清市河务局再次发现运河右岸河套地种植了树木，通过市检察院将拍摄图片及影像资料传送临西县检察院。
原来，尽管上次整治释放出良好的社会效应，但个别村庄个别农户抱有“地在区划外”，属地看不着、外省不敢管的侥幸心理，在运河右岸的河套地种上经济林。
临西县检察院再次启动协作机制，“按图索骥”，很快调查清楚其林地为马村和东温村所有。
在给案涉部门制发检察建议的同时，该院予以跟踪督导，仅7天时间，2村合计面积9200平方米的高秆阻水树木全部整治。

为巩固提升共护大运河公益诉讼成效，临西县检察院秉承实际、实用、实效“三实”原则，充分挖掘科技赋能的潜力，利用“互联网+”和“益心为公”云平台，继续深化和加大运河智能化联网保护工作。
现今，临西县检察院与临清市检察院通过云平台构建，两岸互动协同履职，实现了“一键达”功能和全天候24小时在线守护。
同时，该院还推出了“运河益家”检察文化品牌，以地方省级文化遗产“乱弹”剧种的说唱形式，编制公益节目，送戏下乡，宣传公益检察和法律法规，涵养培树沿河村民“家住运河边、爱河如爱家”的思想意识，以文创软实力相辅佐，确保运河水清河畅的美好水系生态环境。